Peranan sistem kawalan elektronik adalah untuk memastikan bahawa sistem bekalan hidrogen, sistem bekalan udara dan sistem pengurusan air dan haba boleh beroperasi dengan cara yang diselaraskan dan cekap, supaya mereka boleh menggunakan prestasi optimum mereka.

Ia terutamanya terdiri daripada pelbagai sensor, meter aliran, komponen injap, logik kawalan, dll.

